肌肉嫩度儀：江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達量與肉質性狀關聯性分析

   2018年，貴州大學動物科學學院研究人員在國內(nei) 期刊《農(nong) 業(ye) 生物技術學報》在線發表了題為(wei) “江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達量與(yu) 肉質性狀關(guan) 聯性分析"的研究文章。在該論文中，研究人員使用raybet下赌注的RTA-Meat肌肉嫩度儀(yi) 來測定豬肉的剪切力。

  摘要：解耦聯蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為(wei) 重要調控蛋白，主要參與(yu) 機體(ti) 能量代謝調節，在脂質代謝，脂肪酸氧化和脂肪沉積中起著重要作用，對氧化磷酸化反應途徑是否產(chan) 生ATP起決(jue) 定性作用。為(wei) 研究UCP3 基因與(yu) 豬肉質性狀之間的關(guan) 係，本研究測定了165 頭江口蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項肉質性能指標，利用混合DNA池擴增UCP3 基因全部外顯子，測序篩選SNPs 位點，用單個(ge) 樣本DNA擴增SNPs 位點對應外顯子並測序，以驗證位點和分型，分析各位點不同基因型江口蘿卜豬肉質性能差異。采用qRTPCR檢測了UCP3 基因在背最長肌中的表達量，進行基因型、肉質性能以及基因表達量的相關(guan) 性研究。研究結果發現了6 個(ge) SNPs 位點，g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體(ti) 遺傳(chuan) 參數分析發現除g.10479A>G/T位點外的其他位點雜合度高，說明群體(ti) 內(nei) 等位基因分布比較均勻；有效等位基因數高，表明群體(ti) 內(nei) 變異程度大；多態信息含量均大於(yu) 0.25，為(wei) 中度多態，表明位點可以提供一定的遺傳(chuan) 信息。χ2檢驗顯示6 個(ge) 位點均極顯著偏離Hardy-Weinberg 平衡。連鎖不平衡分析發現，g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點為(wei) *連鎖不平衡，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為(wei) 強連鎖不平衡。SNPs 位點與(yu) 肉質的關(guan) 聯性分析發現g.10479A>G/T位點TT型和GG型個(ge) 體(ti) 大理石紋評分顯著高於(yu) AA型和AG型個(ge) 體(ti) ，剪切力則反之；基因型與(yu) 背最長肌中UCP3 基因表達量的關(guan) 聯性分析發現，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(ge) 位點上均為(wei) 突變型個(ge) 體(ti) 表達量極顯著高於(yu) 另外兩(liang) 種基因型；UCP3 基因在背最長肌中的表達量與(yu) 兩(liang) 項肉質指標存在極顯著相關(guan) 性，其中與(yu) 剪切力負相關(guan) ，與(yu) 肌內(nei) 脂肪含量正相關(guan) 。本研究結果表明，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位點為(wei) 影響江口蘿卜豬肉質性能的重要SNPs位點，且UCP3 基因表達量提高有利於(yu) 肌內(nei) 脂肪的沉積，此研究結果為(wei) 篩選有助於(yu) 江口蘿卜豬肌內(nei) 脂肪沉積的分子標記提供了參考依據。